ระบบ AI สามารถแยกส่วนก้อนมะเร็งสมองจากภาพได้อัตโนมัติ

0
https://news.developer.nvidia.com/wp-content/uploads/2018/11/MRI.png

ในแต่ละปีมีคนจำนวนหลายพันคนในสหรัฐอเมริกานั้นถูกวินิจฉัยว่ามีก้อนมะเร็งสมองอยู่ เพื่อที่จะช่วยให้แพทย์สามารถวิเคราะห์ ดูแล และตรวจสอบติดตามก้อนมะเร็งได้อย่างมีประสิทธิภาพที่ดีขึ้น นักวิจัยจาก NVIDIA จึงได้พัฒนาระบบที่ใช้เทคนิค deep learning ที่มีความทนทานในการนำเอาภาพ MRI 3 มิติมาเพื่อแยกส่วนก้อนมะเร็งได้อัตโนมัติ ซึ่งการแบ่งส่วนนี้ได้บอกขอบเขตของก้อนมะเร็งที่มองว่าเป็นพื้นที่ที่ได้รับผลกระทบไปเรียบร้อยแล้วได้

ในหลายๆ ประเทศที่ยังขาดแคลนผู้เชี่ยวชาญที่ได้รับการฝึกฝนมานั้น เทคโนโลยีนี้อาจกลายเป็นเครื่องมือช่วยชีวิตที่ให้บริการได้ภายใน 1 วัน ที่จะช่วยให้ผู้ป่วยได้รับการดูแลตามที่พวกเขาต้องการได้

“การแบ่งส่วนของก้อนมะเร็งสมอง 3 มิติได้อัตโนมัตินั้นสามารถช่วยลดเวลาของแพทย์ได้และช่วยให้มีโซลูชันที่สามารถทำซ้ำได้ด้วยความแม่นยำสำหรับการวิเคราะห์และติดตามก้อนมะเร็งได้ต่อเนื่อง โดยในงานนี้พวกเราได้อธิบายวิธีการแบ่งส่วนตามความหมาย (semantic segmentation) สำหรับการทำการแยกส่วนก้อนมะเร็งสมองซึ่งเป็นปริมาตร 3 มิติจากภาพ MRI 3 มิติหลากหลายรูปแบบ ซึ่งได้ชนะเลิศการแข่งขัน BraTS 2018” คุณ Andriy Myronenko นักวิจัยอาวุโสที่ NVIDIA กล่าว

https://news.developer.nvidia.com/wp-content/uploads/2018/11/Screen-Shot-2018-11-26-at-8.36.35-PM.png
ตัวอย่างการแยกส่วนก้อนมะเร็งสมอง

 

การแข่งขัน BraTS หรือ Multimodal Brain Tumor Segmentation Challenge นั้นเป็นการแข่งขันระดับ international ที่มุ่งเน้นไปที่การแยกส่วนก้อนมะเร็งสมอง โดยการแข่งขันจัดโดยโรงเรียนแพทย์ Perelman School of Medicine มหาวิทยาลัยเพนซิลเวเนีย (University of Pennsylvania)

ในงานที่พัฒนานี้ คุณ Myronenko ได้มุ่งไปที่เนื้องอกไกลโอมา (glioma) หนึ่งในประเภทก้อนเนื้องอกสมองที่เกิดขึ้นจำนวนมาก โดยไกลโอมาที่มีระดับสูงนั้นจะเป็นประเภทเนื้องอกสมองที่มีร้ายแรงมากขึ้น และเครื่องมือที่ดีทึ่สุดของแพทย์ที่จะวินิจฉัยได้ก็คือภาพ MRI อย่างไรก็ดี กระบวนการที่จะอธิบายภาพออกมาโดยกระบวนการ manual หรือว่าเป็นการระบุตำแหน่งที่ถูกต้องของขอบเขตหรือขอบก้อนมะเร็งนั้นจำต้องมีความเชี่ยวชาญเกี่ยวกับกายวิภาค ซึ่งกระบวนการนี้มีค่าใช้จ่ายที่สูงและมีโอกาสที่จะผิดพลาดได้ด้วย นั่นคือเหตุผลว่าการแยกส่วนได้อัตโนมัตินั้นจึงเป็นเครื่องมือที่สำคัญ

โดยคุณ Myronenko ได้เทรนโครงข่าย encoder-decoder convolutional neural network กับภาพสแกน MRI แบบต่างๆ จาก 19 สถาบันเพื่อที่จะทำให้คัดแยกฟีเจอร์ต่างๆ จากภาพ MRI ออกมาได้ โดย encoder จะแกะ feature ออกมาจากภาพ แล้ว decoder จะสร้างหน้ากากการแบ่งส่วนตามความหนาแน่นของภาพนั้นๆ ออกมา

https://news.developer.nvidia.com/wp-content/uploads/2018/11/Screen-Shot-2018-11-26-at-8.28.24-PM.png
โครงสร้างการออกแบบโครงข่าย

 

“ระหว่างการเทรน พวกเราใช้การตัดภาพแบบแรนดอมขนาด 160x192x128 ซึ่จะทำให้มั่นใจได้ว่าข้อมูลในภาพเกือบทั้งหมดนั้นจะยังคงอยู่ในพื้นที่ที่ตัดออกมา” คุณ Myronenko กล่าว

โดยการแข่งขัน BraTS 2018 นั้นเมื่อทดสอบกับชุดทดสอบแล้วได้ผลลัพธ์อยู่ที่ 0.7664, 0.8839 และ 0.8154 เฉลี่ยต่อลูกบาศก์ สำหรับผลจากการแยกส่วนของก้อนเนื้อที่กำลังขยาย ก้อนเนื้อทั้งหมด และ core ของก้อนเนื้อตามลำดับ คุณ Myronenko เขียนไว้ในงานตีพิมพ์

Source : https://news.developer.nvidia.com/automatically-segmenting-brain-tumors-with-ai/